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      cfDNA/ctDNA测序
       

      进行高通量测序用于癌症早期诊断、用药和监测。

       
      样本类型
      新鲜血液
       
      样本总量
      8 mL
       
      交付周期
      30天(可加急)

      服务介绍

       

      血浆游离DNA,即cfDNA(cell-freeDNA),是血浆中游离存在的DNA,主要来源于正常细胞、异常细胞(如肿瘤细胞)和外部(如病毒DNA)。而血液循环肿瘤DNA,即ctDNA(circulating tumor DNA),是cfDNA中来源于肿瘤细胞的那一部分DNA,由肿瘤细胞释放入血,对ctDNA体细胞突变的检测可用于癌症早期诊断、用药和监测。

      技术流程

       

      cfDNA

      文库制备

      上机测序

      数据质控

      数据分析

      技术参数

       

      测序深度

      根据具体项目而定

      测序平台

      HiSeq,PE150

      应用实例

       

      cfDNA:cfDNA检测错误率比传统检测低百倍

      Norton, M.E., et al., Cell-free DNA analysis for noninvasive examination of trisomy. New England Journal of Medicine, 2015. 372(17): p. 1589-1597.

      胎儿染色体三体无细胞DNA(cfDNA)检测在高风险的女性中非常有效。然而,很少有在怀孕未满三个月的常规产前人群中直接比较cfDNA检测和标准产筛检测的研究。在这项在35个国际中心进行的前瞻性、多中心、双盲研究中,研究人员让10-14孕周的孕妇分别接受标准非整倍体筛查检测(颈部透明带和生化分析的测量)和cfDNA检测。在接受调查的18955名妇女中,有15,841份结果可供分析。平均产妇年龄为30.7岁,检测时的平均胎龄为12.5周。cfDNA检测21三体的AUC为0.999,标准筛查的AUC为0.958(P = 0.001)。在38个接受标准cfDNA检测的女性中都检测到21三体(100%; 95%CI,90.7-100),在38个接受标准筛查女性中检测到30名21三体(78.9%; 95% CI, 62.7- 90.4)(P = 0.008)。假阳性率分别为标准筛查组0.06%(95%CI,0.03-0.11)和cfDNA组5.4%(95%CI,5.1-5.8)(P < 0.001)。cfDNA检测的阳性预测值为80.9%(95%CI,66.7-90.9),标准筛查为3.4%(95%CI,2.3-4.8(P<0.001)。在这个大规模常规产筛人群中,对于21三体检测,相比颈部透明和生物化学分析物的测定的标准筛查,cfDNA有更高的灵敏度、更低的假阳性率和更高的阳性预测值。

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      三体综合征的AUC

      ctDNA:ctDNA检测预测癌症复发

      Tie, J., et al., Circulating tumor DNA analysis detects minimal residual disease and predicts recurrence in patients with stage II colon cancer. Science Translational Medicine, 2016. 8(346): p. 346ra92-346ra92.

      检测阶段II期结肠癌切除术后患者的循环肿瘤DNA(ctDNA)可识别复发风险最高的患者并有助于制定辅助治疗方案。研究人员对来自230位前瞻性队列的阶段II期结肠切除术后结肠癌患者的1046份血浆样品进行大规模平行测序,旨在分析ctDNA检测微小残留病的能力。在未接受化疗的患者中,ctDNA在术后178例中的14例(7.9%)患者被检测到,11例(79%)在27个月的平均随访期中复发;在164例ctDNA阴性的患者中,复发的只有16例(9.8%)例(HR: 18;95% CI: 7.9-40;P<0.001)。在接受化疗的患者中,化疗结束后ctDNA的存在也与较短的无复发生存期相关联(HR 11; 95% CI:1.8-68; P = 0.001)。阶段II期结肠癌切除术后的ctDNA检测提供了直接的残留病变证据,并可鉴定复发高风险的患者。

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      未接受化疗的患者的无复发生存期。

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